カトリック神言修道会を設立母体とする南山第二学園は、「人間の尊厳のために」という教育目標のもと、聖書の人間観に基づく「人間の尊厳」に目覚めさせ、すべての人間は、神様から頂いた唯一無二のかけがえのない存在であることを自覚させることができるよう最善を尽くします。
「愛徳」と「努力」の精神にしたがい立派な人になるように最善を尽します。
宗教的情操教育による心の育成や個性や社会性の育成に努めます。
安心して学習やその他の活動に取り組むことができるように努めます。